我院内镜中心由原肛肠科内镜中心和消化内科内镜室整合而成。中心依托国家重点专科、重点学科肛肠科，以及国家重点专科建设单位、湖南省重点专科脾胃病科，于2019年7月被授权为世界内镜医师协会肛肠协会以及国际肛肠内镜考评学院，2021年8月被国家消化内镜质量控制中心授予结肠镜规范化培训项目基地，2023年入选湖南省消化内镜专业委员会委员单位，2024年入选湖南省消化内镜医疗质量控制委员单位。在本院被评为2019年度目标管理卓越科室，2020年度新业务拓展明星科室，2021年度技术创新先导科室，2022年度新技术业务拓展明星科室，2023年度高风险手术开展先进科室。

本中心目前有工作人员15人，医生8人，专科护士6人，洗消工作人员1人，其中正高3人，副高5人，开设了内镜门诊（位于门诊楼四楼，坐诊专家及时间可查询医院官网专家门诊），能够开展各项内镜下检查与手术治疗。

内镜中心位于华佗楼3楼C区最里面，拥有先进的电子胃十二指肠镜、电子结肠镜、放大内镜、胶囊内镜等诊疗系统。入口处有患者及家属候诊区，门口有专科护士负责内镜的预约、登记、叫号及咨询服务；进入诊疗区有3间独立的胃肠镜检查与手术治疗室、1间苏醒室、1间医生办公室（麻醉门诊）及胶囊内镜室；诊疗区后方有1间单独的清洗消毒室及内镜储藏室。整体环境舒适，流程完备合理，围绕患者为中心开展了个体化诊疗及一站式服务。